基因機器 基因機器

基因機器

基因機器

生物學界的「影印機」就是PCR儀。 PCR,即聚合酶鍊式反應,如今已成為犯罪現場鑑定、遺傳測試和生物體劫持等領域的必備工具。它是一項令人嘆為觀止的技術。在構成DNA遺傳密碼的數十億個鹼基對中,PCR能夠找到精確的序列,並在幾個小時內複製數十億份——足以解碼或拼接出有用的基因組合。專業的PCR儀每台售價約1萬美元,但拉塞爾·杜雷特(Russell Durrett)用PVC管、一個150瓦的燈泡、一個電腦風扇、一個廉價的微控制器和一些他從網上訂購的試劑,自製了一台。

1)堆積

將五段 PVC 管堆疊起來形成一個筒倉[右圖],用於存放裝有 DNA 的小瓶,用燈泡加熱,用電腦風扇冷卻。

頂部:在傾斜適配器的頂部鑽十幾個 1/4 英寸的孔(用於固定小瓶),將一根管子裝入適配器的底座中,並在裸露的管子上切出一個方形孔,以匹配電腦風扇的排氣口。

中間部分:在直管PVC接頭的頂部切出一個方形端口,並用熱熔膠將風扇固定到位。在接頭側面中心上方鑽一個孔,用螺栓固定一個夾式燈泡插座。

底部:在第二個連接器上鑽一個孔,用於連接 Arduino Uno 微控制器的線束。

2)接線

將插座和電腦風扇連接到 5 伏特繼電器,並將繼電器連接到 Arduino。將插座的一條導線連接到 110 伏特交流電源,並將熱敏電阻連接到 Arduino。將熱敏電阻放入裝有礦物油和水的樣品瓶中,然後將樣品瓶放入 Arduino 的孔中。這樣 Arduino 就能獲得溫度數據,進而控制燈泡(以及加熱器)的開關。

3)選擇一個基因

無論你是檢測早餐麥片中是否含有基因改造穀物,還是進行愛滋病毒抗性篩檢,都要選擇一個基因來複製。你需要從網路上訂購能夠劫持DNA複製分子的試劑[請參閱下一頁的「運作方式」]。

工作原理

PCR 儀器透過循環溫度來活化 DNA 複製試劑,包括引子、核苷酸和 Taq 聚合酶。

201華氏度
大眾科學

201華氏度

DNA暫時解旋成兩條鏈。

131°F
大眾科學

131°F

引子——能夠「啟動」複製的小段DNA——附著在基因的末端。

162°F
大眾科學

162°F

Taq 聚合酶辨識引物,與其結合,並複製引子之間的 DNA。

……並重複

在最初的五分鐘內,PCR 反應會複製出兩個基因拷貝。隨後的 30 秒循環會繼續進行基因拷貝數的加倍。到第八個循環時,基因拷貝數達到 256 個,到第 30 個循環時——
幾個小時後——數量超過了十億。

時間: 5小時
費用: 50美元
難度: 3/5

如需查看Durrett的完整組裝說明,請下載此PDF檔案。 Arduino程式碼可在此處取得。

本文原刊於2013年5月刊的《大眾科學》雜誌點此看雜誌全文。